Psichoanalitinė psichoterapija tyrinėja, kaip pasąmonė veikia žmogaus mintis, jausmus ir elgesį ir kaip ankstyvieji santykiai su tėvais, vaikystės patirtys ir vėlesni išgyvenimai formuoja psichikos struktūrą. Psichoterapeutas analizuoja paciento pasakojimą, sapnus ir perkėlimo reiškinius, siekdamas padėti pacientui išspręsti giliai įsišaknijusius psichikos konfliktus.